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Best practice per la diagnostica delle malattie sistemiche di Autoinflammatory

April 20, 2020

Le linee guida aggiornate riflettono il vasto uso di ordinamento di prossima generazione, dei geni causativi recentemente identificati e della comprensione mutevole dei modelli di eredità per le malattie rare con i sintomi di sovrapposizione.
L'implementazione diffusa dei metodi d'ordinamento di prossima generazione di (NGS), con l'identificazione di nuovi geni connessi con e una nuova comprensione dei modelli di eredità per le malattie autoinflammatory sistemiche (SAIDs), ha condotto la società internazionale delle malattie Automatico-infiammatorie sistemiche (ISSAID) e la rete di qualità europea di genetica molecolare alle linee guida dell'aggiornamento sulla diagnostica del SAIDs.
Le linee guida di best practice, che compaiono nell'emissione di aprile di chimica clinica, inoltre offrono le informazioni affinchè i professionisti sanitari ed i genetisti diagnostichino e per amministrare giustamente i trattamenti infiammazione-mirati a. Inoltre, le linee guida contribuiscono a trarre le conclusioni adeguate circa le varianti del DNA per il SAIDs-tale come indipendentemente da fatto che considerare un determinato genotipo confermativo per la malattia, Marielle van Gjin, PhD, dell'università di dipartimento di Groninga della genetica nei Paesi Bassi e dell'autore corrispondente delle linee guida. «Circa 1.300 varianti del DNA negli otto geni sono state classificate dagli esperti e un'interpretazione di consenso è stata messa a disposizione pubblicamente - laboratori non esperti e d'aiuto con l'interpretazione dei risultati dei test genetici.»
SAIDs comprende la febbre Mediterranea familiare, la carenza di ADA2, il haploinsufficiency di A20, la carenza della chinasi di acido mevalonico, le sindromi periodiche cryopyrin-collegate, l'artrite pyogenic, il gangrenosum della piodermite e l'acne, proteinemia in relazione con mieloide di PSTPIP1-associated infiammatorio e sindrome periodica ricevitore-collegata di TNF. SAIDs è associato con vari sintomi, compreso febbre, la sierosite, le lesioni cutanee, l'artralgia/artrite, dolore addominale acuto ed a volte, lesioni del sistema nervoso centrale. I sintomi possono sovrapporrsi fra SAIDs, tuttavia, sottolineante l'importanza di usando la prova genetica per diagnosticare esattamente lo stato di un paziente, il trattamento iniziale dell'iniziato ed impediscono le complicazioni serie.
Quattro febbri ricorrenti ereditarie (HRFs) connesso con i geni MEFV, MVK, TNFRSF1A e NLRP3 erano il primo gruppo identificato fra SAIDs monogenic. Hanno «hanno fornito una comprensione in fisiopatologia di SAIDs. Un difetto comune è disturbi della fisioregolazione e/o il overactivation delle vie intracellulari delle cellule immuni innate,» ha scritto gli autori della linea guida.
Le linee guida precedenti dal 2012 sono state basate sui quattro geni più classici che causano HRFs, identificato con Sanger che ordina, hanno detto van Gjin. L'aumento in NGS, tuttavia, ha indicato un'associazione fra HRFs ed i fenotipi inattesi, i modi nonclassical di eredità e le varianti postzygotic.
«Al giorno d'oggi, la maggior parte dei laboratori usano il NGS che ordina la tecnica per la selezione simultanea dei geni multipli,» van Gjin hanno spiegato. «Questo, accanto a diagnosticare più pazienti, inoltre provoca più pazienti che sono identificati con le varianti di importanza sconosciuta e/o le varianti comuni in geni multipli.» Oltre ai nuovi geni ed alle varianti del DNA, i modi novelli di eredità e l'eterogeneità genetica ed allelic aumentata ha fatto la prova genetica per il complesso di SAIDs, in grado di portare alle conclusioni ambigue o ingannevoli, lei hanno aggiunto. Ciò ha richiesto una rivalutazione del protocollo diagnostico genetico.
Le nuove linee guida emanate dai membri europei della rete di qualità di genetica molecolare sono state presentate prima di un comitato di esperti del ISSAID nel corso di una riunione di consenso. Sulla base dell'esperienza in molti esperti e del tipo di mutazioni malattia-causanti individuate nei geni differenti, i partecipanti «hanno proposto un albero di decisione per aiutare i laboratori per decidere quale strategia per scegliere per una prova genetica efficiente e per evitare rilevazione inutile delle varianti del DNA di importanza clinica sconosciuta,» van Gjin ha detto.
Le nuove linee guida riflettono l'uso della tecnologia di NGS e le raccomandazioni circa quattro geni di importanza recentemente identificati in SAIDs: ADA2, NOD2, PSTPIP1 e TNFAIP3. Gli autori inoltre contemplano le alterazioni genetiche patogene nonclassical ed i fenotipi atipici.
Parecchie scoperte importanti accompagnano queste nuove linee guida. le variazioni di Copia-numero, per esempio, sono state conosciute per contribuire a MVK, a ADA2 e a TNFAIP3. Per questo motivo, «dovrebbero essere considerate per quei disordini quando nessuna o soltanto una mutazione può essere individuata,» van Gjin hanno detto.